למרות שינוי המשימות בסמוך למבצע ועל אף התקלות והעיכובים בשלבי ההחפה, התנועה של היעדים, והלחימה על יעד מספר 6, הושגו מטרות המבצע במלואן. במהלך המבצע נהרגו כ-20 מחבלים, הושמדו 4 מבנים, נלקח אמל"ח וסירות כשלל, כך נפגעה תשתית המחבלים לפיגועים בשטחינו דרך הים. לכוחותינו 2 הרוגים ו-8 פצועים. מבצע "שלכת", היה הראשון לאחר "מבצע ליטאני", וראשון מסוגו מזה זמן רב - מבחינת היעדים, הרכב הכוחות ומורכבות הפעולה.